整合抑制（integrative suppression）指由质粒等整合到染色体后产生的抑制。例如，在高温条件下开始不具复制启动能力的大肠杆菌突变型中，当F因子等一类能自主复制的单位（replicon）整合到上述突变型的染色体上之后，即可使原来寄主细胞的复制启动机能的缺失而外观上得到回复。这时随着F因子的复制，在高温条件下亦可见到大肠杆菌的复制活动。在这种情况下，如果F因子不整合到染色体，只是独立存在于细胞中，则宿主染色体仍不能复制。这里F因子整合到染色体形成一条连续的DNA分子，是保证复制启动的必要条件。